پایگاه تخصصی دانشنامه موضوعی قرآن با دارا بودن بیش از هفت هزار مقاله، بزرگ‌ترین بانک مقالات قرآنی در اینترنت است و زیر نظر مدیریت پژوهش‌های رسانه‌ای مرکز فرهنگ و معارف قرآن کریم اداره می‌شود.
پایگاه تخصصی دانشنامه موضوعی قرآن زیر نظر مدیریت پژوهش‌های رسانه‌ای مرکز فرهنگ و معارف قرآن کریم اداره می‌شود و حاوی مقالات قرآنی به زبان‌های فارسی و عربی و برای پژوهشگران و علاقه‌مندان به مباحث قرآن فراهم شده است.
شناسایی و گردآوری مقالات این پایگاه هم زمان با طراحی درخت موضوعات از سال 1385 آغاز شد و سالانه تعداد قابل توجهی از مقالات قرآنی به آن افزوده می‌شود و می‌توان گفت این پایگاه با دارا بودن بیش از هفت هزار مقاله، بزرگ‌ترین بانک مقالات قرآنی در اینترنت است.
از خصوصیات پایگاه دانشنامه موضوعی قرآن آن است که مقالات به صورت تمام متن در معرض دید کاربران قرار دارد و امکان چاپ مقالات در آن وجود داشته و از امکانات موتور جستجوی این پایگاه نیز می‌توان به جستجو براساس موضوع، عنوان مقاله، متن مقاله و نام نویسنده اشاره کرد.
موضوعات این پایگاه در دو موضوع کلی علوم قرآن و معارف قرآن طبقه‌بندی شده است؛ علوم قرآن دارای 10 موضوع اصلی است که موضوعات فرعی و زیرشاخه‌های متعددی از آن منشعب می‌شود و معارف قرآن نیز 24 موضوع اصلی دارد که به موضوعات فرعی و زیرشاخه‌های فراوانی تقسیم شده است.
قرآن‌شناسی، اعجاز قرآن، تاریخ قرآن، ترجمه قرآن، تفسیر قرآن، فهم و زبان قرآن، قرائت و تجوید، قرآن‌پژوهی، وحی و مباحث کلی علوم قرآن از عنوان‌های بخش علوم قرآن است که در هر یک عنوان‌های دیگری به چشم می‌خورد.
همچنین از خداشناسی، پیامبرشناسی، امام شناسی، آخرت شناسی، انسان‌شناسی، جهان‌شناسی، اعلام قرآن، اخلاق، ادیان و مذاهب، عرفان، فقه و اصول، فلسفه و منطق، ادبیات و زبان‌شناسی، زن و خانواده، علوم تربیتی و روان‌شناسی می‌توان بخشی از عنوان‌های معارف قرآن نام برد.
در صفحه اصلی این پایگاه تخصصی جدیدترین مقالات به همراه مقالات برگزیده به چشم می‌خورد که از آن جمله می‌توان به شهود در قرآن، مباهله، اسماء حسنی، مثال‌های قرآنی، برکت، نماز، اطمینان قلب، ذکر، وعده‌های خداوند، وهن، رجاء، کتمان حق، مؤمن، عقوق والدین، ذوالقرنین، قارون و حکیم اشاره کرد.
نزول قرآن، صدیقه طاهره همتای قرآن، به ماه روزه میهمان خداییم، باطن قرآن، تأویل از دیدگاه علامه طباطبایی، حق و تکلیف در نگاه قرآن، ویژگی‌های خانواده برتر در اسلام، ازدواج موقت در کتاب و سنت، مقایسه دکترین منجی‌گرایی در اسلام و مسیحیت و مفهوم، فلسفه و فواید حجاب از مقالات برگزیده این بخش است.
جستجوی مقالات، جستجوی موضوعات، پایگاه معارف قرآن و پایگاه ترجمه قرآن کریم از دیگر بخش‌های اصلی این پایگاه تخصصی است که به نشانی www.maarefquran.org در دسترس پژوهشگران علوم قرآنی قرار دارد.