به گزارش رهروان ولايت در وبلاگ گروه اينترنتی ولایت فقیه و حکومت اسلامی آمده است:وحدت حوزه و دانشگاه نه به معنای وحدت رویه و یکی کردن روش و متد علمی است و نه ادغام حوزه و دانشگاه مراد است؛ بلکه حوزه باید به تکالیف خودش و دانشگاه به وظایف خودش بپردازد البته این دو باید هماهنگ و همسوی با هم باشند یعنی گرچه در استراتژی و تاکتیک با هم متفاوتند ولی در اصول باید مشترک و همسو با یکدیگر بوده و برای پیشبرد نظام اسلامی تلاش کنند.
از همین رو حضرت امام به وحدت اندیشه در اصول كلى اسلام و انقلاب معتقد بود و اختلاف در راهكارها و جزئیات را مانع اصول كلى وحدت نمىدانست. آن پیر فرزانه با دوراندیشی تمام خط مشی حوزه و دانشگاه را برای همیشه اینگونه بیان نمود: «من به شما و تمام نسل‌هایی که بعد از شما و ما خواهند آمد هشدار می‌دهم که ملت و روحانیت، دانشگاه و روحانیت، از هم جدا نشوند که جدا شدن اینها از هم؛ هلاکت ملت و هلاکت اسلام و هلاکت کشور است.»1
البته لازمه ی این وحدت مبارک آن است که از یک طرف، حوزه خود را از علوم روز و زبان روز بىنیاز احساس نكند و از طرفی دیگر دانشگاه نیز تنها بر علوم پایه و تجربى تكیه نداشته باشد و با مبادلات علمی و فرهنگی میان همدیگر موجب هم افزایی علمی و فرهنگی این دو نهاد شده و مکمل یکدیگر باشند و در سایه ی ایمان به خدا و ترکیب یافته های حوزه و دانشگاه به بخشی از همان علمی که سعادت دنیا و آخرت را برای بشریت به ارمغان می آورد دست یازند.
-----------------------------------------------
1- سخنرانی حضرت امام (ره) در جمع روحانیون دفتر تبلیغات حوزه ی علمیه، در تاریخ 59/12/14